佳木斯大学是一所综合性大学，专业设置涵盖多个学科领域，注重应用型人才培养。学校在工学、医学、教育学等学科上具有较强实力，部分学科已形成特色优势。
| 学科门类 | 代表专业 | 特色与优势 |
| 工学 | 机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化 | 实践性强，与地方产业结合紧密 |
| 医学 | 临床医学、护理学 | 师资力量雄厚，附属医院资源丰富 |
| 教育学 | 教育技术学、学前教育 | 注重教学实践，服务区域基础教育 |
| 管理学 | 会计学、工商管理 | 强调应用能力，就业前景良好 |
总体来看，佳木斯大学在学科建设上不断优化，注重教学质量与学生实践能力的提升，为地方经济社会发展培养了大量人才。
