南京农业大学工学院是南京农业大学下属的一个学院，而南京农业大学是一所“双一流”高校，其本科教育在多数省份属于一本批次招生。因此，南京农业大学工学院的本科专业通常也按一本标准进行招生。
综上，南京农业大学工学院的本科专业一般属于一本层次，具体以各省招生计划为准。
