明朝南直隶作为京师所在,其军事地位十分重要。但南直隶并无固定“军事长官”一职,其军事事务多由中央派遣官员或地方将领负责。
总结如下:
综上,南直隶的军事管理以总兵官为主,辅以都司、巡抚等,无单一固定军事长官。